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扶病精神疾病的”癲佬神探”李俊，雖已經被警局開除，但為查清案件真面目，形單影隻躋身案發現場，並由“神探”留住的線索推求出下一個事發的地址。之間相交了在警局斥之為“神探小兩口”的陳儀（蔡卓妍飾）和方禮信（林峯飾）。
乘機劇情的推進，劊子手案、魔警案、雨夜殺人魔案、旺角烹屍案、油麻地飛屍案這些從前舊案，連發地翻出，這些案件中的真兇也不輟被殺死。李俊也在迭起地阻攔殺戮的歷程中，慢慢地揭秘“神探”的面具。
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《神探大戰》後果公案大白，方禮信幹掉李俊的閨女後被燒死，李俊歸來了警局。方禮信末尾承認了敦睦是魔警案和屠夫案的真兇，李俊的丫頭也是方禮信下毒手，之所以李俊差錯壞東西，方禮信才是癩皮狗。
骨子裡，李俊和方禮信的背景很像，方是年少時未遭內親和阿哥的家暴，性格極端。李俊則是突遭妻妾苦於自盡打擊，幼女又倒戈混社會，打擊之下精神失常丟了坐班。其次，兩人都是能力死去活來下狠心的人，毫無二致是神探。
結合兩人的背景，後果現出一面鏡子，一面是李俊，一方面是方禮信，這就不難理解了。李俊有太多和方禮信的相似之處，回返悲慘、心魔無數，唯有是瞬息，就有可能活成對方的後果。也即便直接手本在說的：“與妖精征戰，小心談得來化作精怪”，以及“當你凝視絕地，萬丈深淵也在凝視着你”。
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