在未来的星际世界中，各个行星都纳入联邦的管制。上部的强将军因犯了事儿被降级，发配到了火星空间站。
在那里，小强主要负责在模拟环境里训练新兵蛋子。果然这些队友没让小强失望，菜就不说了，而且他们全都是拖后腿的猪队友。小强日子还算闲情，但一场突如其来的灾难就打破他的平静。
舰队监测到火星表面突然涌现大批虫族，继而向太空中的舰队发起了攻击。小强临危不乱，在舰船爆炸的瞬间，带领部下脱离险境向火星进发。不想跃入大气层后，他们就遭到电浆虫的猛烈攻击，一到地面，大批虫族就源源不断地向他们袭来。
随即，小强就带领部下进行了顽强的反击。费了一番力气后部队暂缓的局势。不过，战士们的伤亡却是小强心头的痛，这就是上课不好好培训的下场。落地成盒真替你们感到悲哀呀。
为抵抗虫族攻占火星，小强利用了迷你核弹进行的打击。然而，伴随着一声剧烈的爆炸，残酷的弹药问题将他们拉回了现实。由于弹药耗尽，他们只能祈祷救援飞船的出现。好在天线宝宝的祈祷得到响应，一艘火星巡逻舰发现他们踪迹，可就在一行人准备离开的时候，虫族的突袭让局势紧张了起来。
经过一番厮杀，队长小强却因动力不足堕入了虫坑。魔性爆发入侵后，联邦大元帅阿花去打起了自己的算盘。在这个只看数据的网红时代，为了获得民众支持，阿花不惜让火星成为自己的票仓。原来联邦早已暗中放弃了火星殖民地，所以在火星遭到袭击后，小强他们才没有获得任何援助。不过即便是这样小强还是顽强的活了下来。
昏迷中的小强被一个大妹子发现，没想到唤醒的方式如此之残忍。醒来后的小强还以为自己死了，因为眼前的这个大妹子在上部就已经死了，那这幻觉又是怎么回事呢？原来联邦中的卡尔洞察到了情况，因被阿花劫持，索性就得知了阿花毁灭火星的计划。
恰巧卡尔用念力发现遗留在火星的小强，两人从小又是至交，为了救老友为了救火星，卡尔告知了小强阿花要毁灭火星的计划。为了谋得更高的权位，阿花大肆渲染火星被虫族攻陷的假象，借此动用Q弹毁灭火星，达到铲除虫族的目的。
这样一来便极大的建立威信。卡尔希望小强前往气象台，以找到打败虫族挽救火星的方法。可路上一只嚣张的虫子拦住了去路。好家伙，花里胡哨的小强反手就送了盒饭。不过小强盔甲已经耗损报废了。就在抵达气象塔的路上，小强发现了双方交战的残骸，结果尾随的虫子吹响了恰饭的号角，紧急关头小强就地拾取装备进行了顽强的反抗。最后逃至气象塔的小强迎来了虫族的围剿。
就在小强准备献身的时候，猪队友竟然杀回来救主了。紧接着队友加入到了战斗当中。不过仅凭几人的小队，就能拦住千军万马的虫族还是有点辣眼睛，关键是在防守过程中还挂掉了几个。现在他们要做的是使用气象塔的核反应堆，制造爆炸，从而消灭火星上的虫族。就在小强指挥作战时，阿花又开启了炸火星的直播，并准备引爆Q弹。
不巧Q蛋就埋在气象塔底部，发现的队友顺便就解除了Q弹的威胁，而且还通过直播揭穿了阿花的阴谋，让所有人看到火星并没有完全沦陷，而是还有人为之在抗争。最终，阿花的谎言不攻自破。但如何摆脱虫族倒成了一行人的麻烦，蜂拥而来的虫族挤满整个基地，到处都是激烈交火，无奈一行人只能往高处避难，但设定的爆炸即将在十分钟后爆炸。
所幸在这个关键时刻，卡尔用念力通知的女舰长赶到了现场，凭借盔甲的机动，战士们火速向飞船转移。最后在小强的带领下，大家都有惊无险摆脱了困境。随着他们的离去，气象塔产生的爆炸消灭了所有在场的虫族。这次小强成功化解了火星的危机，而卡尔也取代了阿花，成为了新的指挥官。
然而对于小强来说，他与虫族的战斗才刚刚开始，因为他即将带领部下夺回被虫族控制的火星。
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